Sieht nicht gut aus...
Ich würde deine Meinung teilen, dass das Wasser genau da eintritt, wo du vermutest. Und du kannst das jetzt auch erstmal mit Dichtstoff XY zuschmieren, damit das Auto wieder dicht ist.
Allerdings wird dir das auf Dauer nicht helfend, da wird der Rost schon deutlich mehr gefressen haben, als du jetzt sehen kannst. Die Scheibe muss raus, jeglicher Rost entfernt werden, alles wieder sauber versiegelt und lackiert werden und erst dann hast du Ruhe.