Aus Platzproblemen kann ich mir vorstellen, dass es Vorteilhaft sein kann gleich das Getriebe mit auszubauen. Wenn Deines aber noch in Ordnung ist wechsle es an den "neuen" Motor. Gleich mitmachen: Ausrücklager der Kupplung erneuern. Die Kupplung würde ich auch gleich checken, welche die Bessere ist. Wenn es nicht auf den Tag ankommt nimm Dir bevor Du mit dem Umbau beginnst den Motor vor, der rein soll und tausche einiges vorsorglich aus: Neu abdichten vermeidet Ärger auf längere Frist und Dichtungen sind nicht soooo teuer. Pleulager würde ich Dir auch vorschlagen, wenn Du Dir das zutraust, ist eigentlich nicht so schwer und Du tust Deinem Motor wirklich was Gutes. Schmeiss den alten Motor nicht weg, meist ist ja nur ein Teil betroffen, der Rest geht noch, dann kann z.B. mal irgendwann die Ölpumpe o.Ä. gebraucht werden.
Gruß - Björn